《超时空同居》的彩蛋是官方提前发布的片尾九个彩蛋中的三个“土味情话”彩蛋，具体内容为：“123木头人，不许动”“对不起我输了，我心动了”；“我们现在是朋友吗?是啊”“那以后就不是了，因为你是我女朋友”；“你知道世界上最冷的地方是哪吗?”“是没有你的地方”。
《超时空同居》的结局中，2018年的佟丽娅并没有真正消失。当陀螺停止转动后，佟丽娅随之消失，但这只是时空连接中断，她回到了自己的时空。他们最后的对话也暗示了这一点，双方都祝福对方以后要“好好的”。这表明，佟丽娅只是回到了原本属于自己的时空，而非像2018年的雷佳音那样因命运的改变而真正“消亡”。
