汉字的机内码分为第一级与第二级，其中第一级的 3755 个汉字置于 16 区至 55 区，按音序排列，同音字以第一笔的横竖撇点折为序，第一笔相同的以第二笔的横竖撇点折为序，依此类推。第二级的 3008 个汉字置于 56 区至 87 区，按部首排列（所采用的部首与一般字词典基本相同，略有改并，共有 186 部），同部首字按笔画数排列，同笔画数字以第一笔的横竖撇点折为序，第一笔相同的以第二笔的横竖撇点折为序，依此类推。
按部首在编码字符集中分区域是不可行的。其一，预设的部首分区使编码字符集的编码空间丧失紧凑性；其二，预设的部首分区无法预测因未来产生的需求或未来可行的需求引致的扩充；其三，汉字归部的多开门性导致同一个汉字在同一个编码字符集中具有多个码位，使编码字符集丧失唯一性。
