转账支票的存根仅仅是一种凭证，主要有以下作用：
1、查账；用来做会计凭证入账；
2、转账支票是出票人签发的，委托办理支票存款业务的银行在见票时无条件支付确定的金额给收款人或持票人的票据；在银行开立存款账户的单位和个人客户，用于同城交易的各种款项，均可签发转账支票，委托开户银行办理付款手续。转账支票只能用于转账。
支票存根联，必须连同发票、进仓单，或借据一起入账。
示例1：购进货物
借：存货
贷：银行存款。
示例2：报销费用
借：管理费用
贷：银行存款。
示例3：职员借款
借：其他应收款
贷：银行存款。
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