先说结论:会。
因为这里边就是存在利益，而且不小，那自然会有人想去吃这个蛋糕。
这个人可能是京东内部的员工，也可能品牌方内部的员工，自营店的逻辑大概就是品牌方把货放到京东的各个仓库里边，用户下单后就直接从京东仓库发货，这也是为什么京东大部分地区能做到次日达的原因。
虽然有假货，但是京东官方是不大可能主观意识的卖假货，同样品牌方自己生产的全是正品，去买一堆假货干嘛？成本对于品牌方来说可能是一样的，甚至假货更贵，他们也不太可能主观意识卖假货。
所以问题就出在品牌把货运送到京东仓库以及京东仓库放到用户手里这两个环节，如果品牌方有内鬼，一批货里掉包一点，京东也没法知道啊，特别是很多鞋子、衣服类的，品牌方自己鉴定假货都老费劲了，更何况京东呢？而且京东很自然会认为品牌方给自己的货是真货啊。
其次就是如果在京东的仓库出现了掉包，品牌方也是无法预知的，他们只知道自己给的肯定是真货。
所以这里边就会出现矛盾，品牌方、京东都认为自己的货是真货，而且本来就是真货，只是内部有人躲避了监管掉包了货，如果没有抓到证据到底是谁的问题，两边是无法说清这个是事情的。
另外这个问题不光是京东自营会出现，哪怕是在官方旗舰店以及线下门店都会出现，不过概率都很低，毕竟要是官方随便就能被掉包，名声早就坏掉了。
