《叛逆者》全43集分集介绍如下：
第1 - 10集：潜伏与觉醒
第1集，复兴社特训班学员林楠笙被陈默群带往上海，要接近朱怡贞打入地下党内部。第2集，林楠笙伪装教师接近朱怡贞并获初步信任，观察到地下党活动痕迹。第5集，顾慎言试探林楠笙，林楠笙因国民党腐败开始动摇。第10集，朱怡贞身份暴露，林楠笙暗中助其逃脱，信仰开始转变。
第11 - 20集：信仰抉择
第15集，林楠笙赴香港执行任务，与左秋明重逢，决心脱离军统。第18集，顾慎言通过钢笔传递信息，林楠笙领悟后冒险传情报。第20集，林楠笙因“通共”被审查，顾慎言为其洗清嫌疑，二人建立秘密联系。
第21 - 30集：抗日烽火
第25集，林楠笙加入“抗日杀奸团”，与地下党炸日军军火库时重伤。第27集，陈默群叛变，林楠笙假意归顺收集罪证，与朱怡贞重逢却无法相认。第30集，左秋明牺牲，林楠笙坚定信念，提交入党申请。
第31 - 40集：黎明前夜
第35集，林楠笙获取国民党“清剿”计划，通过朱怡贞传递，挽救组织危机。第38集，纪中原被捕，林楠笙营救失败后接替其工作。第40集，蓝心洁为掩护林楠笙与敌人同归于尽。
第41 - 43集：终极抉择与结局
第41集，林楠笙接受委托与朱怡贞接头，确认“邮差”身份。第42集，孟安南暴露，林楠笙击毙他后带朱怡贞撤离遇围剿。第43集大结局，二人坠河，林楠笙化名“左老师”潜伏，解放后与朱怡贞重逢，完成信仰蜕变与使命传承。
